Многие интернет-аптеки имеют мобильные приложения для iOS и Android. С их помощью можно заказать лекарства в любое время, отслеживать статус доставки и получать уведомления об акциях. Приложения часто имеют удобный поиск и возможность сохранить список часто покупаемых препаратов. Некоторые сервисы предлагают дополнительные скидки для пользователей мобильного приложения.